全自動高通量植物3D成像系統(tǒng)——Scanalyzer 3D
全自動、高通量對大量植株進(jìn)行3D成像,從幼苗到成株即可
植物表型和生理研究的強大助手
遺傳育種、突變株篩選、表型篩選的強大工具
主要功能
l 全自動、高通量對植物等小型樣品進(jìn)行可見光成像、近紅外成像
l 通過可見光成像可以測量植物的結(jié)構(gòu)、寬度、密度、對稱性、葉長、葉寬、葉面積、葉角度、葉顏色、葉病斑、種子顏色、種子顏色面積等等50多個參數(shù)
l 通過近紅外成像可以分析植物的水分分布狀態(tài)、水力學(xué)研究、脅迫生理學(xué)研究
應(yīng)用實例
l 植物顏色分類
植物的顏色是反映植物健康狀態(tài)的關(guān)鍵指標(biāo)之一,而人肉眼對顏色的敏感度較低,存在較大的視覺誤差。利用Scanalyzer系統(tǒng)可以在拍攝植物可見光照片的基礎(chǔ)上,通過軟件對獲得的顏色信息進(jìn)行銳化處理,從而使原本肉眼不易區(qū)分的顏色差別,顯著的區(qū)分開來。
l 植物骨架/結(jié)構(gòu)分析
植物骨架和架構(gòu)信息,是非常典型的植物表觀信息,是農(nóng)業(yè)信息學(xué)的重要研究內(nèi)容。對于雜交育種而言,Scanalyzer系統(tǒng)有助于快速進(jìn)行表型篩選,也可用于了解整個生活史以及受到脅迫后的骨架/結(jié)構(gòu)變化。
l 植物形態(tài)學(xué)分析
成像后,通過LemnaTec公司專業(yè)的軟件工程師團(tuán)隊開發(fā)的軟件,可以對植物進(jìn)行詳細(xì)的三維形態(tài)學(xué)分析。對于所拍攝的每一張圖片,都可獲得50多個形態(tài)學(xué)參數(shù)。
l 估算生物量
通過頂部成像和多個側(cè)面成像,可以獲得植物X、Y、Z三個軸的信息,根據(jù)各個方向的葉面積、莖長、莖寬、葉長、顏色等來估算植物的生物量。實驗證明這種估算的生物量與實際生物量有非常好的線性關(guān)系。
l 利用近紅外(NIR)成像分析植株和土壤的水分利用情況
近紅外成像可以直觀的反映植物不同部位的含水量,通過軟件處理加上代表不同含水量的顏色后,可以非常直觀的看出不同處理下植株不同部位的含水量變化。如果植物是生長在專用土柱中,還可以對植物根系和土壤的含水量變化進(jìn)行定量分析。
l 利用近紅外(NIR)成像分析NIR成像分析小麥干燥過程中含水量的變化
本例是小麥在高溫處理下,植株含水量的時間動力學(xué)變化可以通過NIR成像直觀的反映處來,并進(jìn)行定量分析。
l 鑒定非轉(zhuǎn)基因植物
噴灑農(nóng)藥后,沒有轉(zhuǎn)入抗農(nóng)藥基因的植物,可以通過顏色鑒定出來。
l 植物個體和群體的形態(tài)學(xué)應(yīng)用舉例
Scanalyzer3D成像系統(tǒng)可以獲得大量的形態(tài)學(xué)參數(shù),并且針對不同的材料,可以獲得有針對性的參數(shù)。下面是幾個例子:
l 植物開花過程的動態(tài)監(jiān)測
由于絕大多數(shù)植物的花的顏色與莖葉不同,利用Scanalyzer 3D成像系統(tǒng)的高通量、全自動、帶電子標(biāo)簽的特性,就可以自動監(jiān)測植物是否開花、開花時間、花朵數(shù)目、花朵發(fā)育階段、花敗時間等信息。