葡萄，是全世界最為廣泛種植的經(jīng)濟(jì)作物之一，作為水果、釀酒原料，葡萄種植始終伴隨人類文明。那么，人類最早栽種葡萄的時(shí)間是什么時(shí)候？釀酒葡萄和鮮食葡萄的起源一樣嗎？這些問題的答案，學(xué)術(shù)界此前一直多有爭(zhēng)論。
云南農(nóng)業(yè)大學(xué)作為第一單位在《Science》上發(fā)表題目為“Dual domestications and origin of traits in grapevine evolution”的文章，該研究由云南農(nóng)業(yè)大學(xué)牽頭，匯集26個(gè)國家和地區(qū)70多名科學(xué)家完成的大型國際合作項(xiàng)目，形成了葡萄起源、遷徙、品種分化研究領(lǐng)域的多個(gè)重要結(jié)論，為葡萄基因組輔助育種、品種溯源提供了重要參考數(shù)據(jù)集，對(duì)葡萄種質(zhì)資源挖掘，推動(dòng)產(chǎn)業(yè)發(fā)展具有重大意義，標(biāo)志著我國葡萄生物資源研究達(dá)到世界領(lǐng)先地位。該論文被Science選為當(dāng)期封面論文，并受邀參加2023年3月Science期刊年會(huì)推薦論文。Science同期還刊發(fā)了題為“Two domestications for grapes”的評(píng)論文章，對(duì)該研究進(jìn)行了介紹并給予了高度評(píng)價(jià)。
該研究成果提出和闡釋了幾個(gè)重要觀點(diǎn)：
1、論證栽培葡萄起源的時(shí)間大約在距今1.1萬年前，遠(yuǎn)比此前人類認(rèn)知的起源時(shí)間要早，表明葡萄是最早馴化的水果，為研究作物起源馴化、葡萄栽培考古學(xué)研究提供了重要線索
2、揭示栽培葡萄馴化中心為兩個(gè)，為雙起源中心模式，糾正了此前的單起源中心理論，是葡萄研究的重要里程碑結(jié)果；
3、證明釀酒葡萄和鮮食葡萄在不同區(qū)域同時(shí)起源，并且起源初期遺傳背景就具有重大的差異，徹底解決了學(xué)術(shù)界對(duì)鮮食葡萄和釀酒葡萄起源長達(dá)數(shù)百年的爭(zhēng)議；
4、構(gòu)建幾乎覆蓋所有栽培葡萄遺傳資源高精度親緣關(guān)系譜系圖，可以實(shí)現(xiàn)葡萄品種的定向育種和設(shè)計(jì)育種；
5、發(fā)現(xiàn)了大量的葡萄人工馴化形狀控制基因，特別是找到了釀酒葡萄和鮮食葡萄人工馴化的差異基因，為葡萄功能基因組學(xué)研究和育種提供素材；
6、在此研究基礎(chǔ)上，結(jié)合人類活動(dòng)、歷史氣候變遷等因素，繪制了葡萄起源和人工馴化、改良的全景圖。
上述研究解決了葡萄研究領(lǐng)域的諸多爭(zhēng)議，我國是世界鮮食葡萄的重要產(chǎn)區(qū)，云南是我國重要的早熟鮮食葡萄產(chǎn)區(qū)，但葡萄產(chǎn)業(yè)發(fā)展卻因“種業(yè)”問題受制于人。立足該成果對(duì)葡萄的經(jīng)濟(jì)性狀控制基因的全面解析，可建立葡萄基因組輔助育種技術(shù)，在短期內(nèi)突破葡萄種業(yè)難題，為我國葡萄產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展保駕護(hù)航。
綜上所述，該研究通過大量測(cè)序、全基因組關(guān)聯(lián)分析等技術(shù)手段解釋了葡萄的馴化起源，對(duì)葡萄育種有著里程碑式的意義。
2 Allaby RG. Two domestications for grapes[J]. Science, 2023, 379(6635): 880-881.
Agripheno?高通量基因分型檢測(cè)平臺(tái)包括高通量Oktopure DNA提取儀、Nexar?模塊化內(nèi)聯(lián)液處理與分析系統(tǒng)、Soellex?高通量PCR水浴熱循環(huán)系統(tǒng)和Araya?內(nèi)聯(lián)熒光檢測(cè)系統(tǒng)。Oktopure DNA提取儀采用磁珠的方法提取DNA，通量達(dá)到800個(gè)樣本/3小時(shí)。同時(shí)，適用于多種樣本類型的DNA提取，包括植物葉片、種子，毛發(fā)、血方卡、精液、口拭子、唾液、組織等。提取的DNA適用于多種下游應(yīng)用，如基因分型、一代測(cè)序、二代測(cè)序等。Nexar高通量吸取樣品DNA和引物、mix至384孔卷帶并封膜。Soellex對(duì)封膜完成的卷帶進(jìn)行PCR水浴熱循環(huán)，每次最多可達(dá)230,000個(gè)樣本。Araya對(duì)水浴完成的卷帶掃描分析，28秒掃描一張卷帶。Agripheno?基因分型采用KASP（Kompetitive Allele Specific PCR）原理，對(duì)目標(biāo)SNPs和InDels進(jìn)行精準(zhǔn)的雙等位基因分型。反應(yīng)體系僅1.6μl，具有高通量、低成本，準(zhǔn)確率和檢出率接近100%的明顯優(yōu)勢(shì)。
| ● 客戶須提供每個(gè)位點(diǎn)至少10個(gè)陽性對(duì)照 |
| ● 服務(wù)周期引物測(cè)試完成后，每批樣品一周內(nèi)出結(jié)果 |
| ● 服務(wù)特點(diǎn)：高通量、低成本、快速準(zhǔn)確 |
DNA提取服務(wù)
根據(jù)目標(biāo)DNA/基因序列,可開發(fā)高效的分子標(biāo)記（SNP-KASP、SSR等），并可實(shí)現(xiàn)單日最高一萬SSR數(shù)據(jù)點(diǎn)，以及數(shù)以十萬計(jì)的SNP數(shù)據(jù)點(diǎn)檢測(cè)。
靶向測(cè)序服務(wù)
靶向測(cè)序技術(shù)主要分為基于多重PCR的靶向基因捕獲技術(shù)（GenoPlexs）和基于液相探針雜交的靶向基因捕獲技術(shù)（GenoBaits）兩種?？赏瓿蓡螛悠?0-5000和3000-40000標(biāo)記的基因型分析，并達(dá)到可設(shè)計(jì)區(qū)域覆蓋度高于95%，擴(kuò)增子均一性高于90%的捕獲效率。
GenoPlex基于多重PCR的靶向基因捕獲技術(shù)方案
GenoBaits基于液相探針雜交的靶向基因捕獲技術(shù)方案
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